Zoids Chaotic Century, en un mundo lejano a muchos años luz del nuestro, existe un planeta conocido como el Planeta Zi, aqui existen maquinas gigantes conforma de animales, conocidos como zoids. Van es un joven muchacho el cual un dia al salir es persequido por bandidos y termina en unas ruinas aqui accidentalmente se encuentra con unos capsulas, de estan salen una extraña criatura conforma de dinosario que Van llama Zic y una chica que se autodemonina Fine, de aqui en adelante lucharan juntos, en busca del pasado de Fine, todo esto en medio de una guerra que a divido al planeta en dos.
